کانتیگ ها چگونه در داربست ها جمع می شوند؟

تصویری: کانتیگ ها چگونه در داربست ها جمع می شوند؟

2024 نویسنده: Miles Stephen | [email protected]. آخرین اصلاح شده: 2023-12-15 23:35

هنگام ایجاد یک پیش نویس ژنوم، خواندن تک تک DNA در درجه اول است به صورت contigs مونتاژ شده است ، که به دلیل ماهیت آنها مونتاژ ، بین آنها شکاف وجود دارد. مرحله بعدی این است به سپس شکاف بین اینها را پر کنید به ایجاد یک داربست . این را می توان با استفاده از نقشه برداری نوری یا توالی جفت جفت انجام داد.

به طور مشابه، ممکن است بپرسید که کانتیگ و داربست چیست؟

آ داربست بخشی از توالی ژنوم است که از کلون‌های شاتگان کل ژنوم با توالی انتهایی بازسازی شده است. داربست ها تشکیل شده اند contigs و شکاف ها آ contig یک طول پیوسته از توالی ژنومی است که در آن ترتیب بازها با سطح اطمینان بالایی مشخص است. در بعضی موارد، داربست ها می تواند همپوشانی داشته باشد.

همچنین، Contigs در بیوانفورماتیک چیست؟ آ contig (از مجاور) مجموعه‌ای از بخش‌های DNA روی هم‌پوشانی است که با هم یک ناحیه اجماع از DNA را نشان می‌دهند. Contigs بنابراین می‌تواند هم به توالی DNA همپوشانی و هم به بخش‌های فیزیکی همپوشانی (قطعات) موجود در کلون‌ها بسته به زمینه اشاره کند.

در این رابطه کانتیگ ها چگونه مونتاژ می شوند؟

مجموعه ای از توالی DNA همپوشانی قطعات DNA به عنوان a شناخته می شود contig . Contig نقشه برداری فرآیندی است که در آن کلون های همپوشانی دارند مونتاژ به ترتیب آن همپوشانی. این شامل ترتیب دادن است contigs به ترتیب و جهت گیری شبیه contigs می تواند به صورت خودکار باشد مونتاژ با استفاده از توالی پایان BAC خود.

چرا کانتیگ ها مهم هستند؟

Contig مونتاژ یک است مهم قدم در مونتاژ ژنوم برای نگاشت، کلون های همپوشانی مونتاژ می شوند تا توالی آن ها همپوشانی داشته باشند. هر قطعه در یک بردار کلون شده و از هر دو انتها توالی یابی می شود تا طول توالی تقریباً 600-700 جفت باز ایجاد شود. توالی هر دو انتهای قطعه DNA را یک جفت می گویند.

توصیه شده:

پروتئین داربست چیست و چرا اهمیت دارد؟

در زیست شناسی، پروتئین های داربست تنظیم کننده های حیاتی بسیاری از مسیرهای سیگنالینگ کلیدی هستند. اگرچه داربست ها به طور دقیق از نظر عملکرد تعریف نشده اند، اما شناخته شده اند که با چندین عضو یک مسیر سیگنالینگ ارتباط برقرار می کنند و/یا به آن ها متصل می شوند و آنها را به مجموعه ها متصل می کنند

وقتی آب و روغن با هم جمع می شوند چه اتفاقی می افتد؟

پس وقتی می خواهید روغن و آب را مخلوط کنید چه اتفاقی می افتد؟ مولکول های آب یکدیگر را جذب می کنند و مولکول های روغن به هم می چسبند. که باعث می شود روغن و آب دو لایه مجزا تشکیل دهند. مولکول‌های آب به هم نزدیک‌تر می‌شوند، بنابراین به پایین فرو می‌روند و روغن روی آب می‌نشیند